Usui Reiki ikinci seviye, birinci seviye bittikten en az 1 ay sonra verilir. Amacı ise öğrencinin Reiki’yi güzelce sindirmesi ve hayatına adapte edebilmesine alan tanımaktır. İkinci seviye uyumlamasıyla kişinin çakraları daha iyi çalışır hale gelir, karmaları şifalanır ve aurası daha da güçlenir. Bu seviyede öğrenci üç adet sembole uyumlanır ve bu sembollerin kullanım alanları anlatılır. Kişi artık bu sembolleri kullanarak uzaktaki ( farklı şehir veya ülkedeki ) kişilere de şifa verebilir.
Semboller kutsal kabul edilir ve sadece ikinci seviye öğrencilerine verilir.

İkinci seviye eğitimi almamış ve bu üç sembole uyumlanmamış kişiler sembolleri kullanamaz.